Το Τμήμα προσφέρει Μεταπτυχιακά Προγράμματα επιπέδου Διδακτορικού στις διάφορες ειδικότητες της Πληροφορικής. Εκτός από τις γενικές απαιτήσεις του Πανεπιστημίου Κύπρου για την απόκτηση του διδακτορικού τίτλου, το Τμήμα αναμένει από τους υποψήφιους διδάκτορες να δημοσιεύουν τα αποτελέσματα της έρευνας τους στα πλαίσια διεθνών συνεδρίων και περιοδικών (journals).
Το πρόγραμμα Διδακτορικού περιλαμβάνει την ολοκλήρωση των μεταπτυχιακών μαθημάτων που ανέρχονται σε τουλάχιστον 60 ECTS μονάδες (η κατοχή σχετικού πτυχίου Μάστερ μπορεί να οδηγήσει σε πλήρη ή μερική ικανοποίηση αυτής της απαίτησης), επιτυχία σε μια περιεκτική εξέταση, αποδοχή της ερευνητικής πρότασης, και τέλος, την υποβολή της πρωτότυπης μελέτης η οποία αποτελεί ουσιαστική συμβολή στο σχετικό πεδίο της γνώσης.
Κάθε μία από τις ανωτέρω απαιτήσεις πρέπει να πληρείται εντός των χρονικών ορίων που καθορίζονται από τους κανονισμούς των Μεταπτυχιακών Σπουδών του Τμήματος.
Η εισδοχή στο Διδακτορικό πρόγραμμα απαιτεί υψηλά ακαδημαϊκά προσόντα στην Πληροφορική και την ικανότητα του Τμήματος να εποπτεύει το θέμα της έρευνας του εκάστοτε φοιτητή.